題目：High-resolution Hi-C maps highlight multiscale 3D epigenome reprogramming during pancreatic cancer metastasis
譯名：高分辨率Hi-C揭示在胰腺癌轉(zhuǎn)移過程中的3D表觀重塑
雜志：J Hematol Oncol
影響因子：17.381
發(fā)表時間：2021
主要技術(shù)：Hi-C，ChIP-seq，RNA-seq，ATAC-seq
樣本選擇：正常胰腺上皮細(xì)胞系，原發(fā)胰腺癌細(xì)胞系，轉(zhuǎn)移胰腺癌細(xì)胞系
主要結(jié)果:
1）研究者發(fā)現(xiàn)在轉(zhuǎn)移的胰腺癌細(xì)胞中，其compartment，contact domains與loop都發(fā)生了顯著的變化，同時其基因組的表觀狀態(tài)也發(fā)生了改變
2）研究者發(fā)現(xiàn)在compartment變化區(qū)域、contact domain變化區(qū)域以及轉(zhuǎn)移胰腺癌特異的enhancer-promoter loop中上調(diào)的基因，與癌癥的轉(zhuǎn)移及病人的預(yù)后不良相關(guān)
3）研究者發(fā)現(xiàn)參與形成轉(zhuǎn)移腫瘤特異的enhancer-promoter loop的轉(zhuǎn)錄因子與腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)
4）研究者發(fā)現(xiàn)LIPC，可能啟動腫瘤轉(zhuǎn)移，該基因通過與腫瘤轉(zhuǎn)移特異的enhancer形成loop
圖1. 多組學(xué)數(shù)據(jù)分析揭示胰腺癌轉(zhuǎn)移過程中的3D表觀重塑相關(guān)關(guān)鍵基因流程圖
圖2. Contact domain改變伴隨表觀基因組的狀態(tài)改變例圖
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